洞庭湖站始终瞄准地方湿地保护的需求，以洞庭湖所存在的问题为导向，利用洞庭湖站坚实监测基础和成熟的湿地生态系统技术，主要开展的工作如下：

（1）   生态修复方面

近几年来先后为东洞庭湖（大小西湖、君山后湖）和西洞庭湖（目平湖）两个国家级自然保护区和横岭湖省级保护区完成了生物多样性保护为目标的湿地生态系统恢复、栖息地恢复和东方田鼠灾害预警计划和实施方案；

（2）   湿地净化方面

完成了多个区域（郴州苏仙区、岳阳屈原区、大围山、望城千龙湖，长沙金井茶厂、紫鹊界等）以水资源和水质保护为主的湿地净化示范项目；

（3）   湿地保护方面

开展20余年的东方田鼠种群动态监测，多次成功预报东方田鼠爆发；开展了湿地植物资源调查，重点清查了外来物种及其入侵的生态学效应；东洞庭湖四种重金属的污染危害顺序为:Cd > Pb > Ni > Cr，Cd最有可能对区域环境造成危害；参与制定了《洞庭湖流域综合管理规划方案》。

（4）   生态农业与管理

为湖南省的6个县市（岳阳屈原、怀化、常德津市、邵阳双清、益阳桃江、益阳安化）制定了国家级或省级农业科技园区规划，并为湖南省制定了《湖南省级农业科技园规划标准和指南》；